Sungguhpun Kanun Tanah Negara merupakan undang-undang tanah yang utama, namun ianya tidak boleh mengatasi beberapa undang-undang tanah yang lain iaitu:
- Terengganu Settlement Enactment 1856
Selain daripada itu peruntukan-peruntukan tidak boleh digunakan jika ianya bercanggah dengan peruntukan-peruntukan mana-mana undang-undang mengenai:
- Tanah Adat
- Tanah Rizab Melayu
- Tanah lombong
- Tanah kesultanan
- Tanah wakaf atau Baitulmal
- Akta Penanaman Padi, 1967
- Ordinan Penyelesaian Tanah Kelantan, 1955
- Akta Tanah (Kawasan Penempatan Berkelompok) 1960
- Mana-mana undang-undang mengenai pengecualian daripada pembayaran hasil tanah.